Обновлённые плагины и файлы здесь (лежат соответственно структуре корневой папки): http://philip.progtech.ru:1111/Miranda_IM_Pack/upd/094pre/
Изменения в настройках:
Настройки → Тонкая настройка → Всплывающие окна — Дополнительно, снять галочку с «Process Miranda IM tray notifications»
Настройки → События → Обновления, снять все галочки (возможно они там и не стоят)
Настройки → Службы → Обновления, снять галочку с «проверять ежедневно» (возможно они там и не стоят)